好久没更新博客了! 前段时间我突然来了兴致,把博客的后端彻底翻新了一遍。现在用的是一个比较新的博客框架,界面看着还挺养眼的。昨天看到一个很有意思的话题，怎么简化一大堆判断？所以准备写这个博客简单讨论一下。
写在前面
昨天我和薏米看了动画片《Coco》，中文是《寻梦环游记》,看完后感触颇深。片中的一个观点让我印象深刻:一个人的死亡并不意味着真正的消失,因为ta的灵魂会到达另一个世界。作为一个搞科研的,我当然明白这种说法缺乏依据。但更让我感到惋惜的是,一个人离世后,在人间可能就没几个人会记得ta了。我忽然想到,对于上一辈,特别是更早以前的老人们来说,受限于时代,他们在世时留下的痕迹可能寥寥无几,最多是些家中为数不多的遗物。像我对爷爷的印象已经相当模糊,对太爷就基本只能从父亲的只言片语中拼凑些许。那个年代,很多人连张像样的照片都没机会留下。
正则表达式算是我最常用的代码技巧吧，因为经常需要文本的模式匹配（就是查找某种字符串）。从我的经验，正则表达式很强大，效率也很高。最近有一个查找转录组中的GQS的项目，正好整理一下正则表达式。
- 基础匹配
- 前向断言
- Kmer
写在前面：
我准备用Python来实现，其实各个语言的正则表达式（Regular expression）语法差异都不大。我不准备写太多基础的东西，就像文档教程那么难看，我就写一些实用的东西。
昨天组会后，和同门讲起曾经我刚进实验室的辛酸历程。2G内存的小服务器，硬是让我做人类基因组数据，于是写程序必须各种优化还得注意控制内存。所以有了今天的想法，聊聊怎么从基因组中提序列。实现的功能不重要，主要是讲一下怎么处理大文件，真正提序列可以用samtools等现有软件，不用重复造轮子。
- 问题描述
- 读取大文件
- 从简单的开始
- Unittest单元测试
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有人给我打赏了！！！！
感谢感谢，希望我的内容对你们有帮助。我平时忙起来特别忙，闲起来特别闲=-=，如果有几个小时的空闲与其看个电影不如写写博客，自己也能学习一下。
马上快毕业了，师妹跟我聊说她现在程序还是不太会写，让我在撤退之前给她补救一下；同时，老婆大人突然励志要奋发努力的学程序，所以我准备推出一系列生信代码教程。主要是通过一些示例，写一下我写生信程序的思路和经验，并不包括具体的语法。第一个就写一个有关polyN定位的例子，示例来自于已经工作的孟师妹问我的一个问题，在此与大家分享。
- 生信案例描述
- 最直接的解决方案
- 适用于更多情况
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我并不想把python的语法或者什么再重复一遍，没有任何意义。现在描述python基本语法的教学网站很多，我推荐几个吧：
那么，接下来，我就从我个人的经验为大家说一下怎么学习Python：
- 做生信为什么要学Python？
- 学Python从哪入手？
- 学Python的工具推荐（python安装、IDE等）
- 最后几个小问题
时间过的好快，上一篇博客还是17年9月写的，现在已经到了18年4月。 这段时间，我已经全面的把机器学习和深度学习融入到我的研究中了，因为我发现这东西实在太神奇了。 做这两个“学习”，我都是用python写的，因为现在各大深度学习平台对Python支持略高，毕竟好学。
