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从TSV换到CSV

此前写代码组织文件,我非常喜欢用TSV这种格式,也就是用Tab分隔,类似bed格式。因为这种格式在terminal里面显示比较整齐,某一列看起来很规整。csv格式相对来说直接看排版就很乱,再加上字符其实差不多,所以没怎么用。但是我最近发现TSV写文件对于缺失值可能会存在一定不好处理的bug。这个博客整理一下我发现的东西,之后看来需要多用CSV格式了。

  • TSV,BED和CSV
  • TSV的BUG
  • 后记

TSV,BED和CSV

TSV、bed 和 CSV 是三种常见的文本文件格式,用于存储表格数据。以下是这三种格式的区别:


Haopeng Yu大约 3 分钟Bioinformatics
寻找最适合生信专业的笔记软件

实验笔记这个事情,导师天天跟你强调这个的重要性。记录好后至少自己的思路是清晰的,防止以后重复造轮子。好记性不如烂笔头嘛~那么问题来了,我要用啥记笔记呢?这篇博客我会把我用到的笔记类东西整理一下,谈谈优缺点,交流一下经验。

  • 1.趁自己还能码!
  • 2.多设备同步的笔记本软件搜罗
  • 3.本地笔记软件

20230309更新

Obsidian真香😃 现在我主要的笔记都用Obsidian管理。 包括个人日记,项目进度,代码管理,这些其实都是markdown格式的,说白了就是一大堆txt在一个文件夹里。 功能上社区支持很足,有很多好用的插件可以用,如果有空我给大家介绍一下。 备份上,用同步盘(我用Dropbox)把这个文件夹同步了就可以。就算以后Dropbox倒闭了,我换个同步盘就可以了。此外Zotero还是我的文献管理软件,很好用。 总的来说:


Haopeng Yu大约 13 分钟Bioinformatics
高效科研与工作的Win10定制攻略

我目前的工作主要在Win平台工作(远程Linux跑程序),感觉在win如果需要高效的工作一些软件是必不可少的。这个博客主要想整理一下我目前用到的,我觉得可以明显提高在Win10平台工作效率的软件以及系统配置。我推荐为高质量的开源软件或免费软件,也希望大家有一定经济实力后可以多捐助支持一下这些优秀的软件。

  • WOX:用键盘敲开一切
  • Linux(WLS)
  • Jupyter-notebook 你的Python和R终端

写在前面:

不要给自己设限,或者说,永远让自己处于可更新的状态。


Haopeng Yu大约 5 分钟Bioinformatics