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Perl语言多线程的简单实现

最近要批量整理一大堆BAM数据,批量Map到转录组固定位点。写了一个单线程的程序,估计了一下,跑完估计得2天,完全等不了。所以开始写准备写perl语言的多线程,经过半个下午的折腾,终于找到了靠谱的方法。感叹一下,perl是不是已经被抛弃了,现在真心是python的天下。

  • 项目的多线程需求
  • 多线程模块Parallel::ForkManager
  • 血泪史
  • 我对Perl语言的理解

项目的多线程需求

我现在把文件压缩成bam格式并且index,现在需要把reads的位点定位在转录本的固定位点上。也就是这是一个单线程不怎么耗时的任务,需要用大量多线程并发来提高效率。


Haopeng Yu大约 6 分钟Perl
生物信息专业如何自学Perl语言

本文为个人经验所写,希望对初进实验室的新手有所帮助。

  • 生物信息都要学习Perl语言吗?
  • 为什么要学习Perl语言?
  • 如何运行Perl?
  • 有什么教程或者资料可以看?

生物信息都要学习Perl语言吗?##

骆驼
骆驼

Haopeng Yu大约 5 分钟Perl